Objectives: To standardize and optimize a PCR assay to detect rrs gene (rRNA 16S) from Leptospira spp. to use it with samples of suspected patients of febrile syndrome, in endemic areas from Peru. Methods: We standardized and validated a PCR assay for rapid diagnostic of leptospirosis from blood and urine samples. The PCR assay was optimized with DNA samples from different species of Leptospira . Sensitivity and specificity was determined in comparison with serological test: MAT and IgM ELISA in 180 clinical samples of patients with suspect of leptopirosis. Results: The PCR assay amplified DNA of twenty five serovars of six pathogenic species of Leptospira spp. No amplification was detected with DNA from other pathogens. Sensitivity and specificity was 100% in vitro (culture samples). In blood samples, sensitivity was 100% (95CI: 97,9 - 100) in patients on the first 8 days of disease; and 30% (95CI: 16,3 - 43,7) when the time of disease was greater. In urine samples the PCR assay showed a low sensitivity. Conclusions: The standardized PCR assay for Leptospira was more sensitive than serological tests in the first days of disease. On the other hand, it has low sensitivity when bacterial population is poor.

Objetivos: Estandarizar y optimizar la prueba de PCR dirigida al gen rrs (16S) de Leptospira spp., para luego validar su uso en muestras de pacientes con síndrome febril captados en zonas endémicas del Perú. Material y métodos: Se estandarizó y validó una prueba de PCR para el diagnostico rápido de leptospirosis en muestras de sangre y orina. Se optimizó la prueba con muestras de ADN de Leptospira de diferentes especies, y se determinó en 180 muestras clínicas de pacientes con sospecha de leptospirosis su sensibilidad y especificidad en comparación con la prueba de aglutinación microscópica (MAT) y ELISA IgM. Resultados: El PCR estandarizado amplificó el ADN de 25 serovares de seis especies de Leptospira spp. No amplificó las muestras de ADN de otros microorganismos patógenos. s. La sensibilidad y especificidaddel método fue 100%in vitro. Su sensibilidad fue de 100% (IC95: 97,9 - 100%) en muestras de sangre antes de los ochoprimeros días de enfermedad y de 30% (IC95: 16,3 - 43-,7) cuando el tiempo de enfermedad fue mayor. El PCR en orinatiene una baja sensibilidad.Conclusiones:El PCR estandarizado es más sensible que las pruebas serológicas en losprimeros días de enfermedad y es poco sensible cuando la carga bacteriana es baja en sangre.